A organização no Obsidian se beneficia quando você tem várias notas curtas interligadas, mas algumas pessoas partem de um acervo de longos textos cheios de capítulos.

É fácil refatorá-las: o Obsidian já vem com o plugin Compositor de Notas. Ative-o nas preferências (em "Plugins Nativos"), e aí é só selecionar um trecho, clicar com o botão direito e pressionar "Extrair seleção atual". A nova nota será criada, e um link será incluído no ponto em que ela foi extraída.

Indo além
O Compositor de Notas faz mais coisas além de criar novas notas a partir da extração de trechos: ele também pode unir notas existentes, e até usar gabaritos ou templates indicando formatação e campos adicionais de informação, a serem usados na criação de notas pelo plugin. Saiba mais na documentação do plugin Note Composer.